In der Methodenwerkstatt stehen, neben der Vermittlung von methodischen Grundkenntnissen, in erster Linie die Weiterentwicklung einzelner methodischen Verfahrensweisen im Vordergrund (Medienethnographie, neue Formen der Interviewforschung, Videographie, Text- und Bildanalyse etc.). Die fachliche Expertise wird in der Regel von Mitgliedern des BZQM abgedeckt, bei Bedarf werden externe Vortragende eingeladen. Neben praktischen Fragen der methodischen Umsetzung werden ebenfalls erkenntnistheoretische, wissenschaftstheoretische und methodologische Prinzipien reflektiert und diskutiert.